Simposio Microbiología Basurto, espiro-osasunet (2018-10-18)

Simposio Microbiología Basurto

Título: Investigación en el Servicio de Microbiología y Control de Infección de la OSI BILBAO-BASURTO

Ponente: José Luis Díaz de Tuesta | Servicio de Microbiología y Control de Infección

Resumen: Se expondrá un resumen de la actividad investigadora realizada en los últimos años; incluyendo los proyectos de investigación liderados o generados por el propio servicio, así como los proyectos de investigación en red, nacionales e internacionales, en los que participa como centro colaborador; todos ellos enmarcados en las líneas de investigación elegidas por el Servicio de Microbiología Clínica y Control de Infección del HUB – OSIBB:

  • Infecciones de transmisión sexual (ITS).
  • Infecciones Relacionadas con la Atención Sanitaria (IRAS).
  • Infecciones por patógenos emergentes y altamente peligrosos.
  • Infecciones por el virus del papiloma humano (HPV).
  • Evaluación y aplicación clínica de nuevos métodos de diagnóstico microbiológico.

Este grupo acaba de entrar en Biocruces Bizkaia. Tienen poco tiempo para hacer investigación, pero hacen cosas interesantes. Colaboran sobre todo con UPV/EHU, no usan la plataforma de Genética. La metagenomica les parece muy interesante pero les queda un poco lejos, podrían usarla cuando exista un “kit” industrial.

Reunión con Nuria Marina sobre espiro.osasunet

El proyecto espiro.osasunet va a integrar 75.000 espirometrías con historias clínicas. Nuria me comenta que el objetivo en principio es hacer consultas simples, pero creo que más adelante podemos intentar hacer algo más interesante. Mi función es almacenar los datos (Mongo?) y pasarselos a Lorea ya listos, un CSV con una línea por paciente.

Quedar por hacer:

  • Integrar/no integrar los datos. Se supone que esta parte la hará Nico González. Si lo hace, es necesaria mi colaboración? Para luego hacer cosas más tipo Big Data.
  • Nuria me mandará datos de prueba para evaluar mongo y ver cuantas horas tengo que meter.
  • Lorea quedará con Nuria, y me avisará, para tener todos claro que datos tenemos (Por ejemplo, las respirometrías son todas en el mismo período?).