Reuniones plataformas (2018-10-17)¶
Plataforma microscopia (Javier Díaz)¶
En cada servicio genera imagenes muy grandes, que los grupos de investigación (“Clientes”) se llevan. Cuando no tiene más sitio en los discos borra los datos.
Plataforma citometria (Miren Sorne)¶
En la misma línea que comentó Luis Castaño (Poner una workstation por cada plataforma para análisis de datos), Miren usa el programa FlowLogic pero el ordenador en el que lo ejecuta es muy malo, necesita algo más potente.
El grupo de Francisco Borrego, Inmunopatología, tiene un Mac potente para esos mismos análisis, pero con otro programa.
Miren también participa en investigaciones cuyos datos igual sería interesante preservar en el repositorio de metadatos, como por ejemplo S:\LABORATO\Investigacion\GENOTIPADO\Danika\00_Estudio LINFOCITOS (No tengo acceso).
Plataforma metabolómica (Fernando Andrade)¶
No tienen problema de tamaño de datos, guardan todo sin borrar nada.
Fernando quiere pedir otro equipo más potente para hacer análisis estadistícos de “metabolómica de verdad”.
La estructura de la plataforma es un poco rara. Tienen proyectos, servicios, investigación, etc.
Un ejemplo de unos datos a preservar serían S:\LABORATO\Metabolopatias\Fernando\Fenilbutirato (no tengo acceso).
Plataforma génetica (updated 19-10-2018)¶
Tienen muchos problemas de almacenamiento:
- Servidor interno (..*.4), con capacidad de un TB, casi lleno.
- Servidor interno (..*.24), con capacidad de un TB, no se puede usar.
- 14 (?!) cuentas en la nube de Ion Torrent.
Además algunos programas de análisis no funcionan bien, como el IGV (Integrative Genome Viewer), por falta de memoria y problemas con Java.
Coordinación de Propuestas, Acuerdos, Convenios y Producción Científica¶
Eunate Arana va a apreguntar a Mari Luz a ver si me puedo meter en proyectos Europeos.
Eva Tabernero, de nuemología, me pone en contacto con Nuria Marina, para un proyecto que consiste en cruzar datos de espirometrias con historiales clinicos. El proyecto lo financia SEPAR. Mi labor consistiría en crear la BBDD cruzada para que Lorea pueda hacer los análisis estadísticos.