Wellcome to biocrucesbizkaia (2018-10-01)

This is my first day at Biocruces. I will have funding for two years, 2019-2020, to work as a bioinformatician. The funding agency is ISCIII.

Posibles colaboraciones:

  • Ana y Gustavo de la plataforma de Genómica. Ahora usan un programa en la nube al que suben directamente los datos desde un Ion Torrent. Se podría mirar cómo analizar los datos directamente y qué análisis hacer.
  • El grupo de investigación de Endocrinologia tiene una BBDD access (???!!!) muy artesanal que hay que normalizar. Una vez normalizada, se podría explorar el convertir la BBDD a grafos RDF, enlazar con BBDD externas y ver si se pueden descubrir cosas nuevas. También podría ser interesante hacer una interfaz de grafo para ver si es mas comodo para los investigadores, con D3?
  • En el grupo de endocrinologia también tienen papers que la parte estadistica no se puede reproducir, ya que no estan los datos originales: Lower Frequency of HLA-DRB1 Type 1 Diabetes Risk Alleles in Pediatric Patients with MODY.